La Maison l'autnid se donne comme mission première de favoriser l’épanouissement et l’intégration des personnes autistes en leur offrant un milieu de vie stable par un hébergement permanent, sécuritaire et stimulant qui est adapté à leur niveau d’autonomie.

Elle se donne aussi comme mission de développer des services et activités complémentaires répondant aux besoins des résidents et à ceux des familles de personnes autistes non résidentes, notamment par un service de surveillance-gardiennage en semaine offert aux familles naturelles grâce, entre autres, au soutien du ministère de la Famille du Québec, au CISSS du Bas-Saint-Laurent et au Centre de service scolaire de Kamouraska-Rivière-du-Loup.