Étant l'une des 10 fondations hospitalières et de la santé du CISSS du Bas-Saint-Laurent, la mission de la Fondation pour les personnes déficientes intellectuelles du Bas-Saint-Laurent est de supporter l'intégration sociale de personnes présentant une déficience intellectuelle (DI ) ou un trouble du spectre de l’autisme (TSA) en accordant des subventions à des demandes faites par la clientèle inscrites ou admises au programme DI-TSA de l’établissement. Les subventions accordées par la Fondation doivent permettre à la clientèle de participer à la collectivité, développer leur autonomie et favoriser leur bien-être ainsi que l’amélioration de leur qualité de vie, malgré les limitations liées à leur diagnostic.